《分子植物育种》是由国家科技部批准，国家新闻出版署核准的刊物。本刊“立足国内，面向国际”，是一份为转基因育种、分子标记辅助育种及常规育种服务的国际化科学杂志。她围绕水稻、小麦、玉米、油菜、大豆、棉麻、薯类、果树、蔬菜、花卉、茶叶、林草等，刊登分子遗传育种理论、分子育种方法、分子育种研究动态以及优良种质培育等方面的科学论文应用成果。。从2003 年创刊以来，已被美国化学文摘(CA)，英国《国际农业与生物科学研究文摘》(CABI)，中国科学引文数据库(CSCD)、中国期刊全文数据库(CJFD)、中文科技期刊数据库，中国核心期刊(遴选)数据库，中国生物学文摘和中国生物学数据库(CBA)等多家中外文献数据库收录。本刊是北京大学图书馆《中文核心期刊要目总览》之核心期刊、中国科学技术信息研究所的中国科技论文统计源期刊之核心期刊；是中国科学院文献情报中心的中国科学引文数据库(CSCD)核心库来源期刊。本刊栏目常设研究论文(Research Article)和研究报告(ResearchReport)，主要发表最新的原始研究成果。随机栏目根据稿源可能设研究评述(AReview)、研究资源(AResource)、数据分析(Analysis)等栏目，还可能设置刊登有关科学新闻、科学简讯、专利、短评、书评等方面的栏目。本刊在栏目设置和文体格式上参照国际著名周刊《自然》及《自然遗传学》的刊发形式。
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研究论文：反映我国植物分子生物学和分子育种领域在基础理论、应用研究和高新技术开发方面的、在国内外公开出版的刊物上尚未发表过的原始研究工作报告。论文篇幅要求在8 个印刷页面以上，相当某些国际刊物的Full length paper。
研究报告：以简要的形式发表的原始研究工作报告。论文篇幅要求在5~8 个印刷页面左右。
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