《中国真菌学杂志》是由海军军医大学长征医院主办，经国家新闻出版总署批准发行的专业性医学学术期刊，双月28日出版。本刊以从事皮肤、感染、血液、呼吸、器官移植、肿瘤、急救、创伤、检验等与真菌感染专业有关的中高级医务人员和从事微生物学、分子生物学及药学等基础研究的研究人员为主要读者群，是真菌学工作者之间学术交流的窗口和平台。主要报道我国真菌学特别是医学真菌学的最新研究进展，内容涉及基础医学及临床医学中的大部分专业。
本刊2008年6月被“中国科技论文统计源期刊（中国科技核心期刊）”收录，成为核心期刊。
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